נולד ברמת גן ב-1952. בגיל 13 עבר עם משפחתו לארצות הברית. לאחר סיום לימודיו התיכוניים, למד קורסים בקולנוע בניו יורק וב-1971 חזר לישראל כדי להתגייס לצבא. בתקופה זו החל לכתוב מאמרים וביקורות על קולנוע, וביים שני סרטים קצרים. ב-1978 ביים את סרטו הארוך הראשון "הלהקה", שהפך להצלחה ביקורתית וקופתית, ועם השנים נחשב לאחת הקלאסיקות הגדולות של הקולנוע הישראלי. גם סרטו השני "דיזנגוף 99" זכה להצלחה. בשנים הבאות, הקריירה של נשר דעכה במקביל למשבר שחל באותה תקופה בקולנוע הישראלי והפך את תעשיית הקולנוע המקומית משוק חופשי של משקיעים פרטיים לכזו המובלת על-ידי קרן בתמיכה ממשלתית ומתמקדת בקולנוע אמנותי.
לאחר הכשלון הביקורתי והקופתי של סרטו "זעם ותהילה" מ-1984, נשר עזב לארצות הברית ושהה שם קרוב ל-20 שנה. בתקופה זו יצר כמה סרטים אמריקאיים, רובם סרטי ז'אנר דלי תקציב (B-movies). בתחילת שנות האלפיים, עם חקיקת חוק הקולנוע, נשר שב לפעול בישראל. לאחר הצלחתו הקופתית הגדולה של סרטו "סוף העולם שמאלה" ב-2004, נשר שב להיות לאחד הבמאים המרכזיים והמצליחים של הקולנוע המקומי. כל הסרטים שביים מאז – "הסודות" (2007), "פעם הייתי" (2010), "פלאות" (2013), "החטאים" (2016) ו"סיפור אחר" (2018) – זכו להצלחה מתמשכת בקרב הקהל הרחב.
